Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGDP52209 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGDP52209 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGDP52209 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGDP52209 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGDP52209 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PGDP52209 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PGDP52209 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGDP52209 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGDP52209 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGDP52209 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGDP52209 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGDP52209 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGDP52209 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGDP52209 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGDP52209 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGDP52209 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGDP52209 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGDP52209 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGDP52209 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGDP52209 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGDP52209 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGDP52209 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGDP52209 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGDP52209 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGDP52209 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGDP52209 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGDP52209 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGDP52209 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGDP52209 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGDP52209 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGDP52209 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGDP52209 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGDP52209 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGDP52209 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGDP52209 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGDP52209 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGDP52209 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGDP52209 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGDP52209 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGDP52209 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGDP52209 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGDP52209 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGDP52209 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGDP52209 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGDP52209 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGDP52209 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGDP52209 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGDP52209 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PGDP52209 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGDP52209 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGDP52209 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGDP52209 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGDP52209 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGDP52209 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGDP52209 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGDP52209 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGDP52209 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGDP52209 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGDP52209 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGDP52209 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGDP52209 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGDP52209 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGDP52209 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGDP52209 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGDP52209 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGDP52209 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGDP52209 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGDP52209 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGDP52209 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGDP52209 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGDP52209 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGDP52209 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGDP52209 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGDP52209 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PGDP52209 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGDP52209 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGDP52209 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGDP52209 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGDP52209 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGDP52209 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGDP52209 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PGDP52209 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGDP52209 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGDP52209 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGDP52209 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGDP52209 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGDP52209 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGDP52209 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGDP52209 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGDP52209 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGDP52209 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGDP52209 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PGDP52209 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGDP52209 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGDP52209 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGDP52209 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGDP52209 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PGDP52209 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGDP52209 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms