Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLCN3P51790 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLCN3P51790 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLCN3P51790 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLCN3P51790 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLCN3P51790 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLCN3P51790 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLCN3P51790 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLCN3P51790 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLCN3P51790 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLCN3P51790 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLCN3P51790 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLCN3P51790 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CLCN3P51790 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLCN3P51790 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLCN3P51790 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLCN3P51790 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLCN3P51790 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLCN3P51790 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLCN3P51790 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CLCN3P51790 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLCN3P51790 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLCN3P51790 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLCN3P51790 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLCN3P51790 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CLCN3P51790 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLCN3P51790 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLCN3P51790 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLCN3P51790 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLCN3P51790 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CLCN3P51790 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms