Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
MTHFSP49914 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
MTHFSP49914 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
MTHFSP49914 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
MTHFSP49914 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
MTHFSP49914 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
MTHFSP49914 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
MTHFSP49914 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
MTHFSP49914 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
MTHFSP49914 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
MTHFSP49914 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
MTHFSP49914 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
MTHFSP49914 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
MTHFSP49914 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
MTHFSP49914 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
MTHFSP49914 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
MTHFSP49914 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
MTHFSP49914 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
MTHFSP49914 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
MTHFSP49914 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
MTHFSP49914 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
MTHFSP49914 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
MTHFSP49914 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MTHFSP49914 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
MTHFSP49914 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
MTHFSP49914 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
MTHFSP49914 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MTHFSP49914 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
MTHFSP49914 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
MTHFSP49914 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
MTHFSP49914 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MTHFSP49914 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MTHFSP49914 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
MTHFSP49914 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
MTHFSP49914 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
MTHFSP49914 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
MTHFSP49914 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
MTHFSP49914 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
MTHFSP49914 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MTHFSP49914 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MTHFSP49914 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
MTHFSP49914 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
MTHFSP49914 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
MTHFSP49914 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
MTHFSP49914 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
MTHFSP49914 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
MTHFSP49914 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
MTHFSP49914 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
MTHFSP49914 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
MTHFSP49914 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
MTHFSP49914 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
MTHFSP49914 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
MTHFSP49914 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MTHFSP49914 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MTHFSP49914 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MTHFSP49914 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MTHFSP49914 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MTHFSP49914 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
MTHFSP49914 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
MTHFSP49914 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
MTHFSP49914 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MTHFSP49914 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
MTHFSP49914 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MTHFSP49914 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MTHFSP49914 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
MTHFSP49914 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
MTHFSP49914 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MTHFSP49914 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MTHFSP49914 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MTHFSP49914 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
MTHFSP49914 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
MTHFSP49914 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
MTHFSP49914 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
MTHFSP49914 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MTHFSP49914 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
MTHFSP49914 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MTHFSP49914 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
MTHFSP49914 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
MTHFSP49914 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MTHFSP49914 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MTHFSP49914 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MTHFSP49914 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MTHFSP49914 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
MTHFSP49914 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MTHFSP49914 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MTHFSP49914 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MTHFSP49914 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MTHFSP49914 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MTHFSP49914 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MTHFSP49914 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MTHFSP49914 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MTHFSP49914 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MTHFSP49914 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MTHFSP49914 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MTHFSP49914 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms