Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUFMP49411 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUFMP49411 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUFMP49411 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUFMP49411 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUFMP49411 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUFMP49411 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUFMP49411 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUFMP49411 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TUFMP49411 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUFMP49411 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUFMP49411 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUFMP49411 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUFMP49411 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUFMP49411 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TUFMP49411 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUFMP49411 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TUFMP49411 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUFMP49411 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TUFMP49411 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUFMP49411 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUFMP49411 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TUFMP49411 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUFMP49411 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUFMP49411 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUFMP49411 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TUFMP49411 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUFMP49411 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TUFMP49411 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TUFMP49411 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUFMP49411 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUFMP49411 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUFMP49411 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUFMP49411 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUFMP49411 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUFMP49411 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TUFMP49411 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUFMP49411 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUFMP49411 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUFMP49411 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUFMP49411 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUFMP49411 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUFMP49411 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUFMP49411 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUFMP49411 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUFMP49411 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUFMP49411 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUFMP49411 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUFMP49411 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUFMP49411 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUFMP49411 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUFMP49411 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TUFMP49411 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TUFMP49411 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUFMP49411 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUFMP49411 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUFMP49411 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUFMP49411 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TUFMP49411 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUFMP49411 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TUFMP49411 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TUFMP49411 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUFMP49411 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUFMP49411 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUFMP49411 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUFMP49411 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUFMP49411 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUFMP49411 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUFMP49411 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUFMP49411 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUFMP49411 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUFMP49411 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUFMP49411 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUFMP49411 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUFMP49411 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUFMP49411 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TUFMP49411 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUFMP49411 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUFMP49411 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUFMP49411 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUFMP49411 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUFMP49411 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUFMP49411 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUFMP49411 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUFMP49411 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUFMP49411 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUFMP49411 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUFMP49411 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUFMP49411 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TUFMP49411 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUFMP49411 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUFMP49411 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUFMP49411 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUFMP49411 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUFMP49411 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUFMP49411 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TUFMP49411 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUFMP49411 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUFMP49411 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUFMP49411 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms