Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TCEA1P23193 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TCEA1P23193 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCEA1P23193 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCEA1P23193 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCEA1P23193 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms