Protein–RNA interactions for Protein: P22735

TGM1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM1P22735 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGM1P22735 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGM1P22735 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
TGM1P22735 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TGM1P22735 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TGM1P22735 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TGM1P22735 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TGM1P22735 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TGM1P22735 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TGM1P22735 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGM1P22735 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGM1P22735 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGM1P22735 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGM1P22735 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGM1P22735 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGM1P22735 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGM1P22735 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGM1P22735 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGM1P22735 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGM1P22735 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGM1P22735 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGM1P22735 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGM1P22735 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGM1P22735 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TGM1P22735 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TGM1P22735 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TGM1P22735 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TGM1P22735 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TGM1P22735 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TGM1P22735 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TGM1P22735 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TGM1P22735 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TGM1P22735 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TGM1P22735 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TGM1P22735 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TGM1P22735 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TGM1P22735 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TGM1P22735 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TGM1P22735 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TGM1P22735 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TGM1P22735 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TGM1P22735 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TGM1P22735 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TGM1P22735 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TGM1P22735 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TGM1P22735 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGM1P22735 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TGM1P22735 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TGM1P22735 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TGM1P22735 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TGM1P22735 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TGM1P22735 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGM1P22735 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGM1P22735 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGM1P22735 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TGM1P22735 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGM1P22735 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGM1P22735 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGM1P22735 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGM1P22735 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGM1P22735 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TGM1P22735 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TGM1P22735 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TGM1P22735 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGM1P22735 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGM1P22735 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGM1P22735 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TGM1P22735 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TGM1P22735 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TGM1P22735 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TGM1P22735 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TGM1P22735 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TGM1P22735 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TGM1P22735 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGM1P22735 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGM1P22735 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGM1P22735 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGM1P22735 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGM1P22735 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGM1P22735 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGM1P22735 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TGM1P22735 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TGM1P22735 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TGM1P22735 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TGM1P22735 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TGM1P22735 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TGM1P22735 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TGM1P22735 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TGM1P22735 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TGM1P22735 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGM1P22735 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGM1P22735 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TGM1P22735 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TGM1P22735 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TGM1P22735 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TGM1P22735 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TGM1P22735 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGM1P22735 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGM1P22735 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TGM1P22735 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms