Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNA5P22460 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNA5P22460 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNA5P22460 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNA5P22460 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA5P22460 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA5P22460 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNA5P22460 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNA5P22460 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNA5P22460 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNA5P22460 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNA5P22460 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNA5P22460 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNA5P22460 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNA5P22460 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNA5P22460 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNA5P22460 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA5P22460 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA5P22460 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNA5P22460 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNA5P22460 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNA5P22460 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNA5P22460 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA5P22460 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA5P22460 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNA5P22460 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA5P22460 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA5P22460 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA5P22460 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCNA5P22460 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCNA5P22460 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCNA5P22460 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA5P22460 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA5P22460 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCNA5P22460 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA5P22460 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA5P22460 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCNA5P22460 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNA5P22460 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCNA5P22460 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNA5P22460 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNA5P22460 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCNA5P22460 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA5P22460 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA5P22460 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA5P22460 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA5P22460 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCNA5P22460 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA5P22460 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA5P22460 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA5P22460 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCNA5P22460 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCNA5P22460 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNA5P22460 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNA5P22460 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCNA5P22460 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNA5P22460 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNA5P22460 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCNA5P22460 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA5P22460 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCNA5P22460 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNA5P22460 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNA5P22460 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNA5P22460 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNA5P22460 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNA5P22460 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNA5P22460 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNA5P22460 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNA5P22460 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNA5P22460 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNA5P22460 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNA5P22460 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNA5P22460 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNA5P22460 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNA5P22460 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNA5P22460 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms