Protein–RNA interactions for Protein: P01282

VIP, VIP peptides, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPP01282 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIPP01282 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VIPP01282 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIPP01282 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIPP01282 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VIPP01282 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VIPP01282 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VIPP01282 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VIPP01282 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VIPP01282 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VIPP01282 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIPP01282 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIPP01282 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIPP01282 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIPP01282 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIPP01282 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VIPP01282 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIPP01282 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIPP01282 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIPP01282 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIPP01282 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIPP01282 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIPP01282 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIPP01282 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VIPP01282 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VIPP01282 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VIPP01282 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIPP01282 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIPP01282 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIPP01282 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VIPP01282 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIPP01282 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIPP01282 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VIPP01282 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
VIPP01282 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIPP01282 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VIPP01282 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VIPP01282 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VIPP01282 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VIPP01282 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VIPP01282 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VIPP01282 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VIPP01282 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VIPP01282 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VIPP01282 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VIPP01282 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIPP01282 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VIPP01282 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIPP01282 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIPP01282 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIPP01282 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIPP01282 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VIPP01282 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIPP01282 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VIPP01282 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VIPP01282 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
VIPP01282 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VIPP01282 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VIPP01282 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIPP01282 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VIPP01282 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VIPP01282 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIPP01282 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIPP01282 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIPP01282 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VIPP01282 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIPP01282 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VIPP01282 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VIPP01282 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VIPP01282 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VIPP01282 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VIPP01282 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VIPP01282 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VIPP01282 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VIPP01282 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VIPP01282 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIPP01282 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIPP01282 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIPP01282 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIPP01282 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIPP01282 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VIPP01282 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIPP01282 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIPP01282 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIPP01282 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIPP01282 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIPP01282 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIPP01282 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VIPP01282 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIPP01282 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIPP01282 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIPP01282 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIPP01282 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIPP01282 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIPP01282 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VIPP01282 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VIPP01282 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VIPP01282 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIPP01282 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VIPP01282 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms