Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GGPS1O95749 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GGPS1O95749 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GGPS1O95749 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GGPS1O95749 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GGPS1O95749 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GGPS1O95749 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GGPS1O95749 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GGPS1O95749 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GGPS1O95749 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GGPS1O95749 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GGPS1O95749 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GGPS1O95749 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GGPS1O95749 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GGPS1O95749 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GGPS1O95749 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GGPS1O95749 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GGPS1O95749 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GGPS1O95749 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GGPS1O95749 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GGPS1O95749 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GGPS1O95749 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GGPS1O95749 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GGPS1O95749 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GGPS1O95749 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GGPS1O95749 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GGPS1O95749 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GGPS1O95749 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GGPS1O95749 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GGPS1O95749 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GGPS1O95749 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GGPS1O95749 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GGPS1O95749 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GGPS1O95749 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GGPS1O95749 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GGPS1O95749 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GGPS1O95749 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GGPS1O95749 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GGPS1O95749 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GGPS1O95749 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
GGPS1O95749 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
GGPS1O95749 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GGPS1O95749 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GGPS1O95749 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GGPS1O95749 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GGPS1O95749 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GGPS1O95749 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GGPS1O95749 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GGPS1O95749 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GGPS1O95749 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GGPS1O95749 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GGPS1O95749 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GGPS1O95749 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GGPS1O95749 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms