Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC6AO75865 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC6AO75865 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC6AO75865 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC6AO75865 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC6AO75865 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC6AO75865 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC6AO75865 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC6AO75865 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC6AO75865 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC6AO75865 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC6AO75865 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC6AO75865 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC6AO75865 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC6AO75865 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC6AO75865 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC6AO75865 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC6AO75865 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC6AO75865 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC6AO75865 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC6AO75865 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC6AO75865 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC6AO75865 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC6AO75865 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC6AO75865 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms