Protein–RNA interactions for Protein: O14904

WNT9A, Protein Wnt-9a, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT9AO14904 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
WNT9AO14904 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WNT9AO14904 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WNT9AO14904 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WNT9AO14904 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WNT9AO14904 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WNT9AO14904 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WNT9AO14904 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WNT9AO14904 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WNT9AO14904 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
WNT9AO14904 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
WNT9AO14904 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
WNT9AO14904 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WNT9AO14904 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
WNT9AO14904 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
WNT9AO14904 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
WNT9AO14904 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
WNT9AO14904 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
WNT9AO14904 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WNT9AO14904 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WNT9AO14904 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
WNT9AO14904 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WNT9AO14904 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms