Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BM21 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H3BM21 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
H3BM21 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BM21 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BM21 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H3BM21 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BM21 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BM21 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
H3BM21 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BM21 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BM21 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H3BM21 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BM21 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BM21 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BM21 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H3BM21 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BM21 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BM21 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BM21 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BM21 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H3BM21 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BM21 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BM21 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H3BM21 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BM21 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BM21 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BM21 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BM21 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H3BM21 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
H3BM21 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BM21 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BM21 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BM21 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BM21 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BM21 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H3BM21 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BM21 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BM21 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
H3BM21 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
H3BM21 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BM21 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BM21 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BM21 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BM21 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BM21 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BM21 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BM21 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BM21 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BM21 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BM21 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BM21 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H3BM21 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
H3BM21 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BM21 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BM21 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H3BM21 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BM21 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H3BM21 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BM21 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BM21 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BM21 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H3BM21 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BM21 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BM21 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BM21 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BM21 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H3BM21 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BM21 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BM21 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BM21 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H3BM21 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H3BM21 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H3BM21 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H3BM21 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
H3BM21 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BM21 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BM21 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BM21 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BM21 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H3BM21 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BM21 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BM21 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BM21 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BM21 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BM21 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BM21 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H3BM21 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BM21 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BM21 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BM21 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H3BM21 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BM21 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BM21 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H3BM21 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BM21 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BM21 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BM21 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BM21 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H3BM21 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms