Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PALM2-AKAP2B1ALY0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PALM2-AKAP2B1ALY0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PALM2-AKAP2B1ALY0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms