Protein–RNA interactions for Protein: A2RRH5

WDR27, WD repeat-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR27A2RRH5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR27A2RRH5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR27A2RRH5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR27A2RRH5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
WDR27A2RRH5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
WDR27A2RRH5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
WDR27A2RRH5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
WDR27A2RRH5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
WDR27A2RRH5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
WDR27A2RRH5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDR27A2RRH5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
WDR27A2RRH5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR27A2RRH5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR27A2RRH5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
WDR27A2RRH5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR27A2RRH5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR27A2RRH5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR27A2RRH5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR27A2RRH5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR27A2RRH5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR27A2RRH5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
WDR27A2RRH5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR27A2RRH5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR27A2RRH5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
WDR27A2RRH5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR27A2RRH5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR27A2RRH5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR27A2RRH5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
WDR27A2RRH5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
WDR27A2RRH5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
WDR27A2RRH5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
WDR27A2RRH5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
WDR27A2RRH5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
WDR27A2RRH5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
WDR27A2RRH5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
WDR27A2RRH5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
WDR27A2RRH5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
WDR27A2RRH5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
WDR27A2RRH5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
WDR27A2RRH5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
WDR27A2RRH5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
WDR27A2RRH5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR27A2RRH5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR27A2RRH5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR27A2RRH5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR27A2RRH5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR27A2RRH5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR27A2RRH5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
WDR27A2RRH5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
WDR27A2RRH5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
WDR27A2RRH5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms