Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX11Q9Y5W9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX11Q9Y5W9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX11Q9Y5W9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX11Q9Y5W9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX11Q9Y5W9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX11Q9Y5W9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX11Q9Y5W9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX11Q9Y5W9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX11Q9Y5W9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX11Q9Y5W9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX11Q9Y5W9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX11Q9Y5W9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX11Q9Y5W9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX11Q9Y5W9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX11Q9Y5W9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX11Q9Y5W9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX11Q9Y5W9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX11Q9Y5W9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX11Q9Y5W9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX11Q9Y5W9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX11Q9Y5W9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX11Q9Y5W9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX11Q9Y5W9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX11Q9Y5W9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX11Q9Y5W9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX11Q9Y5W9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX11Q9Y5W9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX11Q9Y5W9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX11Q9Y5W9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX11Q9Y5W9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX11Q9Y5W9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX11Q9Y5W9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX11Q9Y5W9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX11Q9Y5W9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX11Q9Y5W9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX11Q9Y5W9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX11Q9Y5W9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX11Q9Y5W9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX11Q9Y5W9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX11Q9Y5W9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX11Q9Y5W9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX11Q9Y5W9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX11Q9Y5W9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX11Q9Y5W9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX11Q9Y5W9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX11Q9Y5W9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX11Q9Y5W9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX11Q9Y5W9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX11Q9Y5W9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX11Q9Y5W9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms