Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ICE1Q9Y2F5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ICE1Q9Y2F5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ICE1Q9Y2F5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ICE1Q9Y2F5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ICE1Q9Y2F5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ICE1Q9Y2F5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ICE1Q9Y2F5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ICE1Q9Y2F5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ICE1Q9Y2F5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ICE1Q9Y2F5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ICE1Q9Y2F5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ICE1Q9Y2F5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ICE1Q9Y2F5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ICE1Q9Y2F5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ICE1Q9Y2F5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ICE1Q9Y2F5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ICE1Q9Y2F5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ICE1Q9Y2F5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ICE1Q9Y2F5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ICE1Q9Y2F5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ICE1Q9Y2F5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ICE1Q9Y2F5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ICE1Q9Y2F5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ICE1Q9Y2F5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ICE1Q9Y2F5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ICE1Q9Y2F5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ICE1Q9Y2F5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ICE1Q9Y2F5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ICE1Q9Y2F5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ICE1Q9Y2F5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ICE1Q9Y2F5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ICE1Q9Y2F5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ICE1Q9Y2F5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ICE1Q9Y2F5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE1Q9Y2F5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE1Q9Y2F5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE1Q9Y2F5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE1Q9Y2F5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE1Q9Y2F5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ICE1Q9Y2F5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ICE1Q9Y2F5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ICE1Q9Y2F5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ICE1Q9Y2F5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ICE1Q9Y2F5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ICE1Q9Y2F5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ICE1Q9Y2F5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ICE1Q9Y2F5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ICE1Q9Y2F5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ICE1Q9Y2F5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
ICE1Q9Y2F5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ICE1Q9Y2F5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms