Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATF5Q9Y2D1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATF5Q9Y2D1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATF5Q9Y2D1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATF5Q9Y2D1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATF5Q9Y2D1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
ATF5Q9Y2D1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATF5Q9Y2D1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ATF5Q9Y2D1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ATF5Q9Y2D1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATF5Q9Y2D1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATF5Q9Y2D1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ATF5Q9Y2D1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ATF5Q9Y2D1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ATF5Q9Y2D1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATF5Q9Y2D1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATF5Q9Y2D1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATF5Q9Y2D1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATF5Q9Y2D1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATF5Q9Y2D1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATF5Q9Y2D1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATF5Q9Y2D1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATF5Q9Y2D1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATF5Q9Y2D1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ATF5Q9Y2D1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATF5Q9Y2D1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATF5Q9Y2D1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATF5Q9Y2D1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATF5Q9Y2D1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATF5Q9Y2D1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
ATF5Q9Y2D1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATF5Q9Y2D1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATF5Q9Y2D1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATF5Q9Y2D1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATF5Q9Y2D1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATF5Q9Y2D1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATF5Q9Y2D1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATF5Q9Y2D1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATF5Q9Y2D1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATF5Q9Y2D1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATF5Q9Y2D1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATF5Q9Y2D1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATF5Q9Y2D1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATF5Q9Y2D1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATF5Q9Y2D1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATF5Q9Y2D1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATF5Q9Y2D1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATF5Q9Y2D1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ATF5Q9Y2D1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATF5Q9Y2D1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATF5Q9Y2D1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ATF5Q9Y2D1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
ATF5Q9Y2D1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATF5Q9Y2D1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATF5Q9Y2D1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ATF5Q9Y2D1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATF5Q9Y2D1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ATF5Q9Y2D1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ATF5Q9Y2D1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ATF5Q9Y2D1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATF5Q9Y2D1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATF5Q9Y2D1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATF5Q9Y2D1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATF5Q9Y2D1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ATF5Q9Y2D1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATF5Q9Y2D1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ATF5Q9Y2D1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
ATF5Q9Y2D1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATF5Q9Y2D1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATF5Q9Y2D1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ATF5Q9Y2D1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ATF5Q9Y2D1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATF5Q9Y2D1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ATF5Q9Y2D1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATF5Q9Y2D1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
ATF5Q9Y2D1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ATF5Q9Y2D1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATF5Q9Y2D1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATF5Q9Y2D1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ATF5Q9Y2D1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATF5Q9Y2D1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATF5Q9Y2D1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATF5Q9Y2D1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ATF5Q9Y2D1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ATF5Q9Y2D1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATF5Q9Y2D1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ATF5Q9Y2D1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATF5Q9Y2D1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATF5Q9Y2D1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATF5Q9Y2D1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATF5Q9Y2D1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATF5Q9Y2D1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATF5Q9Y2D1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ATF5Q9Y2D1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ATF5Q9Y2D1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATF5Q9Y2D1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ATF5Q9Y2D1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATF5Q9Y2D1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATF5Q9Y2D1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ATF5Q9Y2D1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms