Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEU3Q9UQ49 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEU3Q9UQ49 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEU3Q9UQ49 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEU3Q9UQ49 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEU3Q9UQ49 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEU3Q9UQ49 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEU3Q9UQ49 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NEU3Q9UQ49 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEU3Q9UQ49 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NEU3Q9UQ49 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEU3Q9UQ49 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEU3Q9UQ49 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEU3Q9UQ49 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEU3Q9UQ49 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NEU3Q9UQ49 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEU3Q9UQ49 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEU3Q9UQ49 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEU3Q9UQ49 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEU3Q9UQ49 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEU3Q9UQ49 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEU3Q9UQ49 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEU3Q9UQ49 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEU3Q9UQ49 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NEU3Q9UQ49 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEU3Q9UQ49 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEU3Q9UQ49 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEU3Q9UQ49 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEU3Q9UQ49 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEU3Q9UQ49 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEU3Q9UQ49 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEU3Q9UQ49 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEU3Q9UQ49 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEU3Q9UQ49 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEU3Q9UQ49 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEU3Q9UQ49 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEU3Q9UQ49 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEU3Q9UQ49 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms