Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
CEP164Q9UPV0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC45.6■■■■■ 4.89
CEP164Q9UPV0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
CEP164Q9UPV0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC45.58■■■■■ 4.89
CEP164Q9UPV0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC45.58■■■■■ 4.89
CEP164Q9UPV0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
CEP164Q9UPV0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
CEP164Q9UPV0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
CEP164Q9UPV0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
CEP164Q9UPV0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC45.55■■■■■ 4.88
CEP164Q9UPV0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
CEP164Q9UPV0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC45.55■■■■■ 4.88
CEP164Q9UPV0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC45.54■■■■■ 4.88
CEP164Q9UPV0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
CEP164Q9UPV0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
CEP164Q9UPV0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC45.54■■■■■ 4.88
CEP164Q9UPV0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.5■■■■■ 4.87
CEP164Q9UPV0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
CEP164Q9UPV0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
CEP164Q9UPV0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
CEP164Q9UPV0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
CEP164Q9UPV0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
CEP164Q9UPV0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
CEP164Q9UPV0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC45.48■■■■■ 4.87
CEP164Q9UPV0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC45.47■■■■■ 4.87
CEP164Q9UPV0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
CEP164Q9UPV0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC45.46■■■■■ 4.87
CEP164Q9UPV0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC45.45■■■■■ 4.87
CEP164Q9UPV0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC45.45■■■■■ 4.87
CEP164Q9UPV0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC45.44■■■■■ 4.87
CEP164Q9UPV0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
CEP164Q9UPV0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
CEP164Q9UPV0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC45.4■■■■■ 4.86
CEP164Q9UPV0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC45.39■■■■■ 4.86
CEP164Q9UPV0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.37■■■■■ 4.85
CEP164Q9UPV0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC45.37■■■■■ 4.85
CEP164Q9UPV0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC45.36■■■■■ 4.85
CEP164Q9UPV0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
CEP164Q9UPV0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
CEP164Q9UPV0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC45.35■■■■■ 4.85
CEP164Q9UPV0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
CEP164Q9UPV0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC45.34■■■■■ 4.85
CEP164Q9UPV0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.33■■■■■ 4.85
CEP164Q9UPV0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
CEP164Q9UPV0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
CEP164Q9UPV0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.32■■■■■ 4.85
CEP164Q9UPV0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC45.3■■■■■ 4.84
CEP164Q9UPV0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
CEP164Q9UPV0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
CEP164Q9UPV0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
CEP164Q9UPV0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC45.27■■■■■ 4.84
CEP164Q9UPV0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
CEP164Q9UPV0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
CEP164Q9UPV0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
CEP164Q9UPV0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
CEP164Q9UPV0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
CEP164Q9UPV0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
CEP164Q9UPV0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC45.19■■■■■ 4.82
CEP164Q9UPV0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
CEP164Q9UPV0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC45.18■■■■■ 4.82
CEP164Q9UPV0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC45.17■■■■■ 4.82
CEP164Q9UPV0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
CEP164Q9UPV0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
CEP164Q9UPV0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
CEP164Q9UPV0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
CEP164Q9UPV0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
CEP164Q9UPV0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
CEP164Q9UPV0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC45.15■■■■■ 4.82
CEP164Q9UPV0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
CEP164Q9UPV0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC45.15■■■■■ 4.82
CEP164Q9UPV0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
CEP164Q9UPV0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC45.14■■■■■ 4.82
CEP164Q9UPV0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
CEP164Q9UPV0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
CEP164Q9UPV0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
CEP164Q9UPV0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
CEP164Q9UPV0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
CEP164Q9UPV0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
CEP164Q9UPV0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
CEP164Q9UPV0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
CEP164Q9UPV0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
CEP164Q9UPV0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC45.08■■■■■ 4.81
CEP164Q9UPV0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
CEP164Q9UPV0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
CEP164Q9UPV0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
CEP164Q9UPV0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC45.05■■■■■ 4.8
CEP164Q9UPV0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
CEP164Q9UPV0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CEP164Q9UPV0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC45.04■■■■■ 4.8
CEP164Q9UPV0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
CEP164Q9UPV0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.03■■■■■ 4.8
CEP164Q9UPV0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
CEP164Q9UPV0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
CEP164Q9UPV0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
CEP164Q9UPV0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC44.99■■■■■ 4.79
CEP164Q9UPV0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
CEP164Q9UPV0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
CEP164Q9UPV0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC44.98■■■■■ 4.79
CEP164Q9UPV0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
CEP164Q9UPV0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.97■■■■■ 4.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms