Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF11Q9UIL8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF11Q9UIL8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF11Q9UIL8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF11Q9UIL8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF11Q9UIL8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF11Q9UIL8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF11Q9UIL8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF11Q9UIL8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF11Q9UIL8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF11Q9UIL8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF11Q9UIL8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF11Q9UIL8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF11Q9UIL8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF11Q9UIL8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF11Q9UIL8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF11Q9UIL8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF11Q9UIL8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF11Q9UIL8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF11Q9UIL8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF11Q9UIL8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF11Q9UIL8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF11Q9UIL8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF11Q9UIL8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF11Q9UIL8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF11Q9UIL8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF11Q9UIL8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF11Q9UIL8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF11Q9UIL8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF11Q9UIL8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF11Q9UIL8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF11Q9UIL8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF11Q9UIL8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF11Q9UIL8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF11Q9UIL8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHF11Q9UIL8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PHF11Q9UIL8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF11Q9UIL8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF11Q9UIL8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms