Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A12Q9NXJ0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MS4A12Q9NXJ0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A12Q9NXJ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MS4A12Q9NXJ0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MS4A12Q9NXJ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A12Q9NXJ0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A12Q9NXJ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MS4A12Q9NXJ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A12Q9NXJ0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A12Q9NXJ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A12Q9NXJ0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MS4A12Q9NXJ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A12Q9NXJ0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A12Q9NXJ0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MS4A12Q9NXJ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A12Q9NXJ0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A12Q9NXJ0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MS4A12Q9NXJ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MS4A12Q9NXJ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MS4A12Q9NXJ0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MS4A12Q9NXJ0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A12Q9NXJ0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A12Q9NXJ0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A12Q9NXJ0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MS4A12Q9NXJ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A12Q9NXJ0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A12Q9NXJ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A12Q9NXJ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A12Q9NXJ0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MS4A12Q9NXJ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A12Q9NXJ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A12Q9NXJ0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A12Q9NXJ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MS4A12Q9NXJ0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A12Q9NXJ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MS4A12Q9NXJ0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MS4A12Q9NXJ0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A12Q9NXJ0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A12Q9NXJ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A12Q9NXJ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A12Q9NXJ0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A12Q9NXJ0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MS4A12Q9NXJ0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A12Q9NXJ0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A12Q9NXJ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MS4A12Q9NXJ0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A12Q9NXJ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A12Q9NXJ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A12Q9NXJ0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A12Q9NXJ0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MS4A12Q9NXJ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MS4A12Q9NXJ0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MS4A12Q9NXJ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A12Q9NXJ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms