Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWS1

PARPBP, PCNA-interacting partner, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARPBPQ9NWS1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARPBPQ9NWS1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARPBPQ9NWS1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARPBPQ9NWS1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARPBPQ9NWS1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARPBPQ9NWS1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARPBPQ9NWS1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PARPBPQ9NWS1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARPBPQ9NWS1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARPBPQ9NWS1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARPBPQ9NWS1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARPBPQ9NWS1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARPBPQ9NWS1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARPBPQ9NWS1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARPBPQ9NWS1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARPBPQ9NWS1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARPBPQ9NWS1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARPBPQ9NWS1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARPBPQ9NWS1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARPBPQ9NWS1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARPBPQ9NWS1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PARPBPQ9NWS1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PARPBPQ9NWS1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PARPBPQ9NWS1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PARPBPQ9NWS1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PARPBPQ9NWS1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARPBPQ9NWS1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARPBPQ9NWS1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARPBPQ9NWS1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARPBPQ9NWS1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARPBPQ9NWS1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARPBPQ9NWS1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PARPBPQ9NWS1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARPBPQ9NWS1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARPBPQ9NWS1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARPBPQ9NWS1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARPBPQ9NWS1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARPBPQ9NWS1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARPBPQ9NWS1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARPBPQ9NWS1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARPBPQ9NWS1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARPBPQ9NWS1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PARPBPQ9NWS1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms