Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS00

C1GALT1, Glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1GALT1Q9NS00 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1GALT1Q9NS00 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1GALT1Q9NS00 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
C1GALT1Q9NS00 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1GALT1Q9NS00 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1GALT1Q9NS00 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1GALT1Q9NS00 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1GALT1Q9NS00 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1GALT1Q9NS00 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1GALT1Q9NS00 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1GALT1Q9NS00 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1GALT1Q9NS00 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C1GALT1Q9NS00 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1GALT1Q9NS00 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1GALT1Q9NS00 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1GALT1Q9NS00 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1GALT1Q9NS00 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1GALT1Q9NS00 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1GALT1Q9NS00 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1GALT1Q9NS00 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1GALT1Q9NS00 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1GALT1Q9NS00 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1GALT1Q9NS00 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1GALT1Q9NS00 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1GALT1Q9NS00 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1GALT1Q9NS00 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1GALT1Q9NS00 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1GALT1Q9NS00 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1GALT1Q9NS00 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C1GALT1Q9NS00 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1GALT1Q9NS00 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C1GALT1Q9NS00 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C1GALT1Q9NS00 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C1GALT1Q9NS00 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1GALT1Q9NS00 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1GALT1Q9NS00 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1GALT1Q9NS00 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
C1GALT1Q9NS00 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1GALT1Q9NS00 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C1GALT1Q9NS00 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C1GALT1Q9NS00 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1GALT1Q9NS00 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1GALT1Q9NS00 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1GALT1Q9NS00 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1GALT1Q9NS00 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1GALT1Q9NS00 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1GALT1Q9NS00 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1GALT1Q9NS00 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms