Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR7

CCDC177, Coiled-coil domain-containing protein 177, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC177Q9NQR7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC177Q9NQR7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC177Q9NQR7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC177Q9NQR7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC177Q9NQR7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC177Q9NQR7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC177Q9NQR7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC177Q9NQR7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC177Q9NQR7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC177Q9NQR7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC177Q9NQR7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC177Q9NQR7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC177Q9NQR7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC177Q9NQR7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC177Q9NQR7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC177Q9NQR7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC177Q9NQR7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC177Q9NQR7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC177Q9NQR7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC177Q9NQR7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC177Q9NQR7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC177Q9NQR7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC177Q9NQR7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC177Q9NQR7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC177Q9NQR7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC177Q9NQR7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC177Q9NQR7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC177Q9NQR7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC177Q9NQR7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC177Q9NQR7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC177Q9NQR7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC177Q9NQR7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC177Q9NQR7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC177Q9NQR7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC177Q9NQR7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC177Q9NQR7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC177Q9NQR7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC177Q9NQR7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC177Q9NQR7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC177Q9NQR7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC177Q9NQR7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC177Q9NQR7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC177Q9NQR7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC177Q9NQR7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC177Q9NQR7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC177Q9NQR7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC177Q9NQR7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC177Q9NQR7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC177Q9NQR7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC177Q9NQR7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC177Q9NQR7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC177Q9NQR7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC177Q9NQR7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC177Q9NQR7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC177Q9NQR7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC177Q9NQR7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC177Q9NQR7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC177Q9NQR7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC177Q9NQR7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC177Q9NQR7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC177Q9NQR7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC177Q9NQR7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC177Q9NQR7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC177Q9NQR7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC177Q9NQR7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC177Q9NQR7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC177Q9NQR7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC177Q9NQR7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC177Q9NQR7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC177Q9NQR7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC177Q9NQR7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC177Q9NQR7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC177Q9NQR7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC177Q9NQR7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC177Q9NQR7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC177Q9NQR7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms