Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HMG20AQ9NP66 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMG20AQ9NP66 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMG20AQ9NP66 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HMG20AQ9NP66 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20AQ9NP66 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20AQ9NP66 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20AQ9NP66 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20AQ9NP66 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HMG20AQ9NP66 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HMG20AQ9NP66 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMG20AQ9NP66 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HMG20AQ9NP66 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HMG20AQ9NP66 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMG20AQ9NP66 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMG20AQ9NP66 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HMG20AQ9NP66 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HMG20AQ9NP66 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMG20AQ9NP66 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HMG20AQ9NP66 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HMG20AQ9NP66 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HMG20AQ9NP66 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20AQ9NP66 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20AQ9NP66 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HMG20AQ9NP66 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20AQ9NP66 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20AQ9NP66 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HMG20AQ9NP66 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20AQ9NP66 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20AQ9NP66 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20AQ9NP66 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HMG20AQ9NP66 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMG20AQ9NP66 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HMG20AQ9NP66 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMG20AQ9NP66 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1655.5 ms