Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCO2Q9BYV7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCO2Q9BYV7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BCO2Q9BYV7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BCO2Q9BYV7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BCO2Q9BYV7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCO2Q9BYV7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCO2Q9BYV7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCO2Q9BYV7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCO2Q9BYV7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCO2Q9BYV7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCO2Q9BYV7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BCO2Q9BYV7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCO2Q9BYV7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCO2Q9BYV7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BCO2Q9BYV7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCO2Q9BYV7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCO2Q9BYV7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BCO2Q9BYV7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BCO2Q9BYV7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCO2Q9BYV7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCO2Q9BYV7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BCO2Q9BYV7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCO2Q9BYV7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BCO2Q9BYV7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
BCO2Q9BYV7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCO2Q9BYV7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCO2Q9BYV7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCO2Q9BYV7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCO2Q9BYV7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BCO2Q9BYV7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCO2Q9BYV7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BCO2Q9BYV7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCO2Q9BYV7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BCO2Q9BYV7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
BCO2Q9BYV7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
BCO2Q9BYV7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCO2Q9BYV7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BCO2Q9BYV7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCO2Q9BYV7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCO2Q9BYV7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCO2Q9BYV7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BCO2Q9BYV7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
BCO2Q9BYV7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BCO2Q9BYV7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BCO2Q9BYV7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
BCO2Q9BYV7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BCO2Q9BYV7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BCO2Q9BYV7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCO2Q9BYV7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCO2Q9BYV7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCO2Q9BYV7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCO2Q9BYV7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCO2Q9BYV7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCO2Q9BYV7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BCO2Q9BYV7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BCO2Q9BYV7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BCO2Q9BYV7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms