Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
STRA6Q9BX79 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRA6Q9BX79 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
STRA6Q9BX79 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRA6Q9BX79 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRA6Q9BX79 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRA6Q9BX79 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRA6Q9BX79 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRA6Q9BX79 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRA6Q9BX79 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRA6Q9BX79 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRA6Q9BX79 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRA6Q9BX79 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRA6Q9BX79 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRA6Q9BX79 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRA6Q9BX79 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRA6Q9BX79 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRA6Q9BX79 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRA6Q9BX79 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRA6Q9BX79 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
STRA6Q9BX79 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRA6Q9BX79 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRA6Q9BX79 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRA6Q9BX79 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRA6Q9BX79 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
STRA6Q9BX79 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRA6Q9BX79 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRA6Q9BX79 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
STRA6Q9BX79 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRA6Q9BX79 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRA6Q9BX79 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
STRA6Q9BX79 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRA6Q9BX79 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRA6Q9BX79 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
STRA6Q9BX79 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRA6Q9BX79 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRA6Q9BX79 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRA6Q9BX79 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
STRA6Q9BX79 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRA6Q9BX79 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRA6Q9BX79 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
STRA6Q9BX79 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRA6Q9BX79 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRA6Q9BX79 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRA6Q9BX79 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
STRA6Q9BX79 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
STRA6Q9BX79 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
STRA6Q9BX79 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRA6Q9BX79 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRA6Q9BX79 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms