Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWJ5

SF3B5, Splicing factor 3B subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B5Q9BWJ5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF3B5Q9BWJ5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF3B5Q9BWJ5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3B5Q9BWJ5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3B5Q9BWJ5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3B5Q9BWJ5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3B5Q9BWJ5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3B5Q9BWJ5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3B5Q9BWJ5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3B5Q9BWJ5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3B5Q9BWJ5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3B5Q9BWJ5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SF3B5Q9BWJ5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SF3B5Q9BWJ5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SF3B5Q9BWJ5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SF3B5Q9BWJ5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3B5Q9BWJ5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms