Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
ARXQ96QS3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
ARXQ96QS3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARXQ96QS3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ARXQ96QS3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ARXQ96QS3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARXQ96QS3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARXQ96QS3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARXQ96QS3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARXQ96QS3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARXQ96QS3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ARXQ96QS3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ARXQ96QS3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARXQ96QS3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ARXQ96QS3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ARXQ96QS3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ARXQ96QS3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ARXQ96QS3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARXQ96QS3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARXQ96QS3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARXQ96QS3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARXQ96QS3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARXQ96QS3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARXQ96QS3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARXQ96QS3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARXQ96QS3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
ARXQ96QS3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ARXQ96QS3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ARXQ96QS3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ARXQ96QS3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ARXQ96QS3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ARXQ96QS3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARXQ96QS3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARXQ96QS3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARXQ96QS3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARXQ96QS3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARXQ96QS3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ARXQ96QS3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
ARXQ96QS3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ARXQ96QS3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ARXQ96QS3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ARXQ96QS3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ARXQ96QS3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ARXQ96QS3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ARXQ96QS3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ARXQ96QS3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ARXQ96QS3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ARXQ96QS3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
ARXQ96QS3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ARXQ96QS3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ARXQ96QS3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
ARXQ96QS3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARXQ96QS3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARXQ96QS3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARXQ96QS3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARXQ96QS3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARXQ96QS3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARXQ96QS3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARXQ96QS3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ARXQ96QS3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARXQ96QS3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARXQ96QS3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARXQ96QS3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARXQ96QS3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARXQ96QS3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ARXQ96QS3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ARXQ96QS3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ARXQ96QS3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ARXQ96QS3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARXQ96QS3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARXQ96QS3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARXQ96QS3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARXQ96QS3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARXQ96QS3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARXQ96QS3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARXQ96QS3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ARXQ96QS3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARXQ96QS3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ARXQ96QS3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARXQ96QS3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARXQ96QS3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARXQ96QS3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARXQ96QS3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARXQ96QS3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARXQ96QS3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARXQ96QS3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARXQ96QS3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARXQ96QS3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARXQ96QS3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
ARXQ96QS3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARXQ96QS3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARXQ96QS3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARXQ96QS3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARXQ96QS3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARXQ96QS3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARXQ96QS3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARXQ96QS3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARXQ96QS3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARXQ96QS3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARXQ96QS3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms