Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
GJD4Q96KN9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
GJD4Q96KN9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
GJD4Q96KN9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
GJD4Q96KN9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
GJD4Q96KN9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
GJD4Q96KN9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
GJD4Q96KN9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
GJD4Q96KN9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
GJD4Q96KN9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
GJD4Q96KN9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
GJD4Q96KN9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
GJD4Q96KN9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
GJD4Q96KN9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
GJD4Q96KN9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
GJD4Q96KN9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
GJD4Q96KN9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
GJD4Q96KN9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
GJD4Q96KN9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
GJD4Q96KN9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
GJD4Q96KN9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
GJD4Q96KN9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
GJD4Q96KN9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
GJD4Q96KN9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
GJD4Q96KN9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
GJD4Q96KN9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
GJD4Q96KN9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
GJD4Q96KN9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
GJD4Q96KN9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
GJD4Q96KN9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
GJD4Q96KN9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
GJD4Q96KN9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
GJD4Q96KN9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
GJD4Q96KN9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
GJD4Q96KN9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
GJD4Q96KN9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GJD4Q96KN9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
GJD4Q96KN9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GJD4Q96KN9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
GJD4Q96KN9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
GJD4Q96KN9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
GJD4Q96KN9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
GJD4Q96KN9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
GJD4Q96KN9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
GJD4Q96KN9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
GJD4Q96KN9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GJD4Q96KN9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
GJD4Q96KN9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
GJD4Q96KN9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GJD4Q96KN9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GJD4Q96KN9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GJD4Q96KN9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
GJD4Q96KN9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
GJD4Q96KN9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GJD4Q96KN9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GJD4Q96KN9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GJD4Q96KN9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GJD4Q96KN9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GJD4Q96KN9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GJD4Q96KN9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GJD4Q96KN9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GJD4Q96KN9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
GJD4Q96KN9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
GJD4Q96KN9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GJD4Q96KN9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
GJD4Q96KN9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
GJD4Q96KN9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
GJD4Q96KN9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
GJD4Q96KN9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
GJD4Q96KN9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
GJD4Q96KN9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
GJD4Q96KN9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GJD4Q96KN9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GJD4Q96KN9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
GJD4Q96KN9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GJD4Q96KN9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
GJD4Q96KN9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
GJD4Q96KN9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
GJD4Q96KN9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
GJD4Q96KN9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
GJD4Q96KN9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
GJD4Q96KN9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
GJD4Q96KN9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
GJD4Q96KN9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
GJD4Q96KN9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
GJD4Q96KN9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GJD4Q96KN9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
GJD4Q96KN9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GJD4Q96KN9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
GJD4Q96KN9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
GJD4Q96KN9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
GJD4Q96KN9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
GJD4Q96KN9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
GJD4Q96KN9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
GJD4Q96KN9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
GJD4Q96KN9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
GJD4Q96KN9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
GJD4Q96KN9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
GJD4Q96KN9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
GJD4Q96KN9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms