Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ7

TM4SF19, Transmembrane 4 L6 family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF19Q96DZ7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF19Q96DZ7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF19Q96DZ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TM4SF19Q96DZ7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF19Q96DZ7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF19Q96DZ7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF19Q96DZ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF19Q96DZ7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF19Q96DZ7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TM4SF19Q96DZ7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TM4SF19Q96DZ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TM4SF19Q96DZ7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TM4SF19Q96DZ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF19Q96DZ7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF19Q96DZ7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms