Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI7

TMC2, Transmembrane channel-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC2Q8TDI7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMC2Q8TDI7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
TMC2Q8TDI7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMC2Q8TDI7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMC2Q8TDI7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMC2Q8TDI7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMC2Q8TDI7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMC2Q8TDI7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMC2Q8TDI7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMC2Q8TDI7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMC2Q8TDI7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMC2Q8TDI7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMC2Q8TDI7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMC2Q8TDI7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMC2Q8TDI7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMC2Q8TDI7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMC2Q8TDI7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMC2Q8TDI7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMC2Q8TDI7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TMC2Q8TDI7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMC2Q8TDI7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMC2Q8TDI7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMC2Q8TDI7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMC2Q8TDI7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMC2Q8TDI7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMC2Q8TDI7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMC2Q8TDI7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMC2Q8TDI7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMC2Q8TDI7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMC2Q8TDI7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMC2Q8TDI7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMC2Q8TDI7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMC2Q8TDI7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMC2Q8TDI7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMC2Q8TDI7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TMC2Q8TDI7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMC2Q8TDI7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMC2Q8TDI7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMC2Q8TDI7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMC2Q8TDI7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TMC2Q8TDI7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMC2Q8TDI7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TMC2Q8TDI7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TMC2Q8TDI7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMC2Q8TDI7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMC2Q8TDI7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMC2Q8TDI7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMC2Q8TDI7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMC2Q8TDI7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMC2Q8TDI7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMC2Q8TDI7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMC2Q8TDI7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMC2Q8TDI7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMC2Q8TDI7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMC2Q8TDI7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms