Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDH2

CCDC168, Coiled-coil domain-containing protein 168, humanhuman

Predictions only

Length 2,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC168Q8NDH2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC168Q8NDH2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC168Q8NDH2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC168Q8NDH2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC168Q8NDH2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC168Q8NDH2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC168Q8NDH2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC168Q8NDH2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC168Q8NDH2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC168Q8NDH2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC168Q8NDH2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC168Q8NDH2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC168Q8NDH2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC168Q8NDH2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC168Q8NDH2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC168Q8NDH2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC168Q8NDH2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC168Q8NDH2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC168Q8NDH2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC168Q8NDH2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC168Q8NDH2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC168Q8NDH2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC168Q8NDH2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC168Q8NDH2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC168Q8NDH2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC168Q8NDH2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC168Q8NDH2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC168Q8NDH2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC168Q8NDH2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC168Q8NDH2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC168Q8NDH2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC168Q8NDH2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC168Q8NDH2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC168Q8NDH2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC168Q8NDH2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC168Q8NDH2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC168Q8NDH2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC168Q8NDH2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC168Q8NDH2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC168Q8NDH2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC168Q8NDH2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC168Q8NDH2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC168Q8NDH2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC168Q8NDH2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC168Q8NDH2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC168Q8NDH2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC168Q8NDH2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC168Q8NDH2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC168Q8NDH2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC168Q8NDH2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC168Q8NDH2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC168Q8NDH2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms