Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCF0

CLEC18C, C-type lectin domain family 18 member C, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC18CQ8NCF0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC18CQ8NCF0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC18CQ8NCF0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC18CQ8NCF0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLEC18CQ8NCF0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLEC18CQ8NCF0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLEC18CQ8NCF0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLEC18CQ8NCF0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLEC18CQ8NCF0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLEC18CQ8NCF0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLEC18CQ8NCF0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLEC18CQ8NCF0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLEC18CQ8NCF0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC18CQ8NCF0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC18CQ8NCF0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC18CQ8NCF0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC18CQ8NCF0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLEC18CQ8NCF0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC18CQ8NCF0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC18CQ8NCF0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC18CQ8NCF0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC18CQ8NCF0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLEC18CQ8NCF0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC18CQ8NCF0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC18CQ8NCF0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLEC18CQ8NCF0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC18CQ8NCF0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC18CQ8NCF0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLEC18CQ8NCF0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC18CQ8NCF0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLEC18CQ8NCF0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC18CQ8NCF0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC18CQ8NCF0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC18CQ8NCF0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC18CQ8NCF0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC18CQ8NCF0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLEC18CQ8NCF0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC18CQ8NCF0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLEC18CQ8NCF0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLEC18CQ8NCF0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLEC18CQ8NCF0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLEC18CQ8NCF0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC18CQ8NCF0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC18CQ8NCF0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLEC18CQ8NCF0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLEC18CQ8NCF0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLEC18CQ8NCF0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLEC18CQ8NCF0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLEC18CQ8NCF0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLEC18CQ8NCF0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLEC18CQ8NCF0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLEC18CQ8NCF0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLEC18CQ8NCF0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms