Protein–RNA interactions for Protein: Q8N823

ZNF611, Zinc finger protein 611, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF611Q8N823 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF611Q8N823 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF611Q8N823 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF611Q8N823 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF611Q8N823 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF611Q8N823 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF611Q8N823 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF611Q8N823 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF611Q8N823 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF611Q8N823 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF611Q8N823 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF611Q8N823 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF611Q8N823 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF611Q8N823 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF611Q8N823 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF611Q8N823 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF611Q8N823 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF611Q8N823 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF611Q8N823 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF611Q8N823 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF611Q8N823 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF611Q8N823 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF611Q8N823 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF611Q8N823 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF611Q8N823 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF611Q8N823 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF611Q8N823 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF611Q8N823 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF611Q8N823 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF611Q8N823 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF611Q8N823 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF611Q8N823 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF611Q8N823 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF611Q8N823 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF611Q8N823 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF611Q8N823 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF611Q8N823 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF611Q8N823 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF611Q8N823 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms