Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALB2Q86YC2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALB2Q86YC2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALB2Q86YC2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PALB2Q86YC2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PALB2Q86YC2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALB2Q86YC2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALB2Q86YC2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PALB2Q86YC2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PALB2Q86YC2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PALB2Q86YC2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PALB2Q86YC2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PALB2Q86YC2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PALB2Q86YC2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PALB2Q86YC2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PALB2Q86YC2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PALB2Q86YC2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PALB2Q86YC2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PALB2Q86YC2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PALB2Q86YC2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PALB2Q86YC2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PALB2Q86YC2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PALB2Q86YC2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PALB2Q86YC2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PALB2Q86YC2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALB2Q86YC2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALB2Q86YC2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALB2Q86YC2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PALB2Q86YC2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PALB2Q86YC2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PALB2Q86YC2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PALB2Q86YC2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PALB2Q86YC2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PALB2Q86YC2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PALB2Q86YC2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PALB2Q86YC2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PALB2Q86YC2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALB2Q86YC2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALB2Q86YC2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALB2Q86YC2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALB2Q86YC2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALB2Q86YC2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALB2Q86YC2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALB2Q86YC2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALB2Q86YC2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PALB2Q86YC2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PALB2Q86YC2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PALB2Q86YC2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALB2Q86YC2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALB2Q86YC2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALB2Q86YC2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PALB2Q86YC2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms