Protein–RNA interactions for Protein: Q86UK0

ABCA12, ATP-binding cassette sub-family A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA12Q86UK0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCA12Q86UK0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCA12Q86UK0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCA12Q86UK0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCA12Q86UK0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCA12Q86UK0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCA12Q86UK0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCA12Q86UK0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCA12Q86UK0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCA12Q86UK0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCA12Q86UK0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCA12Q86UK0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCA12Q86UK0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCA12Q86UK0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCA12Q86UK0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCA12Q86UK0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCA12Q86UK0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCA12Q86UK0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCA12Q86UK0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCA12Q86UK0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCA12Q86UK0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCA12Q86UK0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCA12Q86UK0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCA12Q86UK0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCA12Q86UK0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCA12Q86UK0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCA12Q86UK0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCA12Q86UK0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCA12Q86UK0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCA12Q86UK0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCA12Q86UK0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCA12Q86UK0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCA12Q86UK0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCA12Q86UK0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCA12Q86UK0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCA12Q86UK0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCA12Q86UK0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ABCA12Q86UK0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ABCA12Q86UK0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ABCA12Q86UK0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCA12Q86UK0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCA12Q86UK0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCA12Q86UK0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCA12Q86UK0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCA12Q86UK0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCA12Q86UK0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ABCA12Q86UK0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCA12Q86UK0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCA12Q86UK0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCA12Q86UK0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ABCA12Q86UK0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCA12Q86UK0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCA12Q86UK0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCA12Q86UK0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCA12Q86UK0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCA12Q86UK0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCA12Q86UK0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCA12Q86UK0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCA12Q86UK0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCA12Q86UK0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCA12Q86UK0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCA12Q86UK0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCA12Q86UK0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCA12Q86UK0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCA12Q86UK0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCA12Q86UK0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCA12Q86UK0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCA12Q86UK0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCA12Q86UK0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCA12Q86UK0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCA12Q86UK0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCA12Q86UK0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCA12Q86UK0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCA12Q86UK0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCA12Q86UK0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCA12Q86UK0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCA12Q86UK0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCA12Q86UK0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCA12Q86UK0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCA12Q86UK0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCA12Q86UK0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCA12Q86UK0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms