Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC29A4Q7RTT9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC29A4Q7RTT9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC29A4Q7RTT9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC29A4Q7RTT9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC29A4Q7RTT9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC29A4Q7RTT9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC29A4Q7RTT9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC29A4Q7RTT9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.1 ms