Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q71RC1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q71RC1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q71RC1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q71RC1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q71RC1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q71RC1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q71RC1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q71RC1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q71RC1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q71RC1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q71RC1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q71RC1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q71RC1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q71RC1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q71RC1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q71RC1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q71RC1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Q71RC1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q71RC1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q71RC1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q71RC1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q71RC1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q71RC1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q71RC1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q71RC1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Q71RC1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q71RC1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q71RC1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q71RC1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q71RC1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q71RC1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q71RC1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q71RC1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q71RC1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q71RC1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q71RC1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q71RC1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q71RC1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q71RC1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q71RC1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q71RC1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q71RC1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q71RC1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q71RC1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q71RC1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q71RC1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q71RC1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q71RC1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q71RC1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q71RC1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q71RC1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q71RC1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q71RC1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q71RC1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q71RC1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q71RC1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q71RC1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q71RC1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Q71RC1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q71RC1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q71RC1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q71RC1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q71RC1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q71RC1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q71RC1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q71RC1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q71RC1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q71RC1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q71RC1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q71RC1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q71RC1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q71RC1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q71RC1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q71RC1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q71RC1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q71RC1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q71RC1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q71RC1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q71RC1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q71RC1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q71RC1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q71RC1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q71RC1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q71RC1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q71RC1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q71RC1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q71RC1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Q71RC1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q71RC1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q71RC1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q71RC1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q71RC1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q71RC1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q71RC1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q71RC1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Q71RC1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q71RC1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q71RC1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q71RC1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms