Protein–RNA interactions for Protein: Q6X9E4

FBXW12, F-box/WD repeat-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW12Q6X9E4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXW12Q6X9E4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXW12Q6X9E4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW12Q6X9E4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW12Q6X9E4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXW12Q6X9E4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW12Q6X9E4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW12Q6X9E4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW12Q6X9E4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW12Q6X9E4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW12Q6X9E4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW12Q6X9E4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW12Q6X9E4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW12Q6X9E4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW12Q6X9E4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW12Q6X9E4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW12Q6X9E4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW12Q6X9E4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXW12Q6X9E4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXW12Q6X9E4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXW12Q6X9E4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW12Q6X9E4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW12Q6X9E4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW12Q6X9E4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXW12Q6X9E4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXW12Q6X9E4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXW12Q6X9E4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXW12Q6X9E4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXW12Q6X9E4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXW12Q6X9E4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXW12Q6X9E4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXW12Q6X9E4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXW12Q6X9E4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXW12Q6X9E4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXW12Q6X9E4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXW12Q6X9E4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXW12Q6X9E4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXW12Q6X9E4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXW12Q6X9E4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXW12Q6X9E4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXW12Q6X9E4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXW12Q6X9E4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXW12Q6X9E4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXW12Q6X9E4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXW12Q6X9E4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXW12Q6X9E4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXW12Q6X9E4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXW12Q6X9E4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXW12Q6X9E4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXW12Q6X9E4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXW12Q6X9E4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW12Q6X9E4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW12Q6X9E4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW12Q6X9E4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXW12Q6X9E4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXW12Q6X9E4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms