Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABRAXAS1Q6UWZ7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABRAXAS1Q6UWZ7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABRAXAS1Q6UWZ7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABRAXAS1Q6UWZ7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABRAXAS1Q6UWZ7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABRAXAS1Q6UWZ7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABRAXAS1Q6UWZ7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABRAXAS1Q6UWZ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABRAXAS1Q6UWZ7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABRAXAS1Q6UWZ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABRAXAS1Q6UWZ7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABRAXAS1Q6UWZ7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABRAXAS1Q6UWZ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms