Protein–RNA interactions for Protein: Q6UUV7

CRTC3, CREB-regulated transcription coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTC3Q6UUV7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRTC3Q6UUV7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRTC3Q6UUV7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRTC3Q6UUV7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRTC3Q6UUV7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRTC3Q6UUV7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRTC3Q6UUV7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CRTC3Q6UUV7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRTC3Q6UUV7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CRTC3Q6UUV7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CRTC3Q6UUV7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRTC3Q6UUV7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRTC3Q6UUV7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRTC3Q6UUV7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRTC3Q6UUV7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRTC3Q6UUV7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRTC3Q6UUV7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRTC3Q6UUV7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRTC3Q6UUV7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRTC3Q6UUV7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRTC3Q6UUV7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRTC3Q6UUV7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRTC3Q6UUV7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRTC3Q6UUV7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRTC3Q6UUV7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRTC3Q6UUV7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRTC3Q6UUV7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRTC3Q6UUV7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRTC3Q6UUV7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRTC3Q6UUV7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRTC3Q6UUV7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRTC3Q6UUV7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRTC3Q6UUV7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRTC3Q6UUV7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CRTC3Q6UUV7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRTC3Q6UUV7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRTC3Q6UUV7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CRTC3Q6UUV7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRTC3Q6UUV7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRTC3Q6UUV7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRTC3Q6UUV7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRTC3Q6UUV7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRTC3Q6UUV7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRTC3Q6UUV7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRTC3Q6UUV7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRTC3Q6UUV7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CRTC3Q6UUV7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CRTC3Q6UUV7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CRTC3Q6UUV7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRTC3Q6UUV7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRTC3Q6UUV7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms