Protein–RNA interactions for Protein: Q6TGC4

PADI6, Protein-arginine deiminase type-6, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI6Q6TGC4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PADI6Q6TGC4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PADI6Q6TGC4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PADI6Q6TGC4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PADI6Q6TGC4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PADI6Q6TGC4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PADI6Q6TGC4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PADI6Q6TGC4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PADI6Q6TGC4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PADI6Q6TGC4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PADI6Q6TGC4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PADI6Q6TGC4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
PADI6Q6TGC4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PADI6Q6TGC4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PADI6Q6TGC4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PADI6Q6TGC4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PADI6Q6TGC4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PADI6Q6TGC4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PADI6Q6TGC4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PADI6Q6TGC4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PADI6Q6TGC4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PADI6Q6TGC4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PADI6Q6TGC4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PADI6Q6TGC4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PADI6Q6TGC4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PADI6Q6TGC4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PADI6Q6TGC4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PADI6Q6TGC4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PADI6Q6TGC4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PADI6Q6TGC4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PADI6Q6TGC4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PADI6Q6TGC4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PADI6Q6TGC4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PADI6Q6TGC4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PADI6Q6TGC4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PADI6Q6TGC4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PADI6Q6TGC4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PADI6Q6TGC4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PADI6Q6TGC4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PADI6Q6TGC4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PADI6Q6TGC4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PADI6Q6TGC4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PADI6Q6TGC4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PADI6Q6TGC4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PADI6Q6TGC4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PADI6Q6TGC4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PADI6Q6TGC4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PADI6Q6TGC4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PADI6Q6TGC4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PADI6Q6TGC4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PADI6Q6TGC4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PADI6Q6TGC4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PADI6Q6TGC4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PADI6Q6TGC4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PADI6Q6TGC4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PADI6Q6TGC4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PADI6Q6TGC4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PADI6Q6TGC4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PADI6Q6TGC4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PADI6Q6TGC4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PADI6Q6TGC4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
PADI6Q6TGC4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
PADI6Q6TGC4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PADI6Q6TGC4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PADI6Q6TGC4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PADI6Q6TGC4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PADI6Q6TGC4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PADI6Q6TGC4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PADI6Q6TGC4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PADI6Q6TGC4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PADI6Q6TGC4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PADI6Q6TGC4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PADI6Q6TGC4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PADI6Q6TGC4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PADI6Q6TGC4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PADI6Q6TGC4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.8 ms