Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIF1Q5UIP0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIF1Q5UIP0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIF1Q5UIP0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIF1Q5UIP0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIF1Q5UIP0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RIF1Q5UIP0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RIF1Q5UIP0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RIF1Q5UIP0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RIF1Q5UIP0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RIF1Q5UIP0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIF1Q5UIP0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIF1Q5UIP0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RIF1Q5UIP0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIF1Q5UIP0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIF1Q5UIP0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIF1Q5UIP0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RIF1Q5UIP0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIF1Q5UIP0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RIF1Q5UIP0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RIF1Q5UIP0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIF1Q5UIP0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIF1Q5UIP0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIF1Q5UIP0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIF1Q5UIP0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RIF1Q5UIP0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIF1Q5UIP0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RIF1Q5UIP0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIF1Q5UIP0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RIF1Q5UIP0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RIF1Q5UIP0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RIF1Q5UIP0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIF1Q5UIP0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIF1Q5UIP0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIF1Q5UIP0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIF1Q5UIP0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RIF1Q5UIP0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIF1Q5UIP0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIF1Q5UIP0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RIF1Q5UIP0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RIF1Q5UIP0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIF1Q5UIP0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIF1Q5UIP0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIF1Q5UIP0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIF1Q5UIP0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIF1Q5UIP0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIF1Q5UIP0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIF1Q5UIP0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIF1Q5UIP0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIF1Q5UIP0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIF1Q5UIP0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIF1Q5UIP0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIF1Q5UIP0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIF1Q5UIP0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIF1Q5UIP0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIF1Q5UIP0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIF1Q5UIP0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RIF1Q5UIP0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIF1Q5UIP0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIF1Q5UIP0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIF1Q5UIP0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIF1Q5UIP0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIF1Q5UIP0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIF1Q5UIP0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIF1Q5UIP0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIF1Q5UIP0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIF1Q5UIP0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIF1Q5UIP0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIF1Q5UIP0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIF1Q5UIP0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIF1Q5UIP0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIF1Q5UIP0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIF1Q5UIP0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIF1Q5UIP0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIF1Q5UIP0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIF1Q5UIP0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIF1Q5UIP0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIF1Q5UIP0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIF1Q5UIP0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIF1Q5UIP0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIF1Q5UIP0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIF1Q5UIP0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIF1Q5UIP0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIF1Q5UIP0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIF1Q5UIP0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIF1Q5UIP0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIF1Q5UIP0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIF1Q5UIP0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIF1Q5UIP0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIF1Q5UIP0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIF1Q5UIP0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIF1Q5UIP0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RIF1Q5UIP0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RIF1Q5UIP0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIF1Q5UIP0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIF1Q5UIP0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIF1Q5UIP0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIF1Q5UIP0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIF1Q5UIP0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIF1Q5UIP0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms