Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
SNAPC4Q5SXM2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
SNAPC4Q5SXM2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC43.76■■■■■ 4.6
SNAPC4Q5SXM2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC43.76■■■■■ 4.6
SNAPC4Q5SXM2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
SNAPC4Q5SXM2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
SNAPC4Q5SXM2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC43.74■■■■■ 4.59
SNAPC4Q5SXM2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC43.74■■■■■ 4.59
SNAPC4Q5SXM2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC43.74■■■■■ 4.59
SNAPC4Q5SXM2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC43.74■■■■■ 4.59
SNAPC4Q5SXM2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
SNAPC4Q5SXM2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
SNAPC4Q5SXM2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
SNAPC4Q5SXM2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
SNAPC4Q5SXM2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
SNAPC4Q5SXM2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
SNAPC4Q5SXM2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
SNAPC4Q5SXM2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
SNAPC4Q5SXM2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
SNAPC4Q5SXM2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
SNAPC4Q5SXM2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
SNAPC4Q5SXM2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
SNAPC4Q5SXM2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
SNAPC4Q5SXM2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
SNAPC4Q5SXM2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
SNAPC4Q5SXM2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
SNAPC4Q5SXM2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
SNAPC4Q5SXM2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC43.63■■■■■ 4.57
SNAPC4Q5SXM2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
SNAPC4Q5SXM2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
SNAPC4Q5SXM2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
SNAPC4Q5SXM2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
SNAPC4Q5SXM2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
SNAPC4Q5SXM2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
SNAPC4Q5SXM2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.56
SNAPC4Q5SXM2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.56
SNAPC4Q5SXM2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
SNAPC4Q5SXM2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.55■■■■■ 4.56
SNAPC4Q5SXM2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
SNAPC4Q5SXM2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
SNAPC4Q5SXM2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
SNAPC4Q5SXM2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
SNAPC4Q5SXM2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
SNAPC4Q5SXM2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
SNAPC4Q5SXM2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
SNAPC4Q5SXM2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
SNAPC4Q5SXM2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC43.49■■■■■ 4.55
SNAPC4Q5SXM2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
SNAPC4Q5SXM2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
SNAPC4Q5SXM2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SNAPC4Q5SXM2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SNAPC4Q5SXM2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
SNAPC4Q5SXM2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SNAPC4Q5SXM2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
SNAPC4Q5SXM2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
SNAPC4Q5SXM2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC43.43■■■■■ 4.54
SNAPC4Q5SXM2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
SNAPC4Q5SXM2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
SNAPC4Q5SXM2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC43.38■■■■■ 4.53
SNAPC4Q5SXM2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SNAPC4Q5SXM2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
SNAPC4Q5SXM2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
SNAPC4Q5SXM2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
SNAPC4Q5SXM2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
SNAPC4Q5SXM2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
SNAPC4Q5SXM2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
SNAPC4Q5SXM2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
SNAPC4Q5SXM2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
SNAPC4Q5SXM2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
SNAPC4Q5SXM2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
SNAPC4Q5SXM2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
SNAPC4Q5SXM2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC43.34■■■■■ 4.53
SNAPC4Q5SXM2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
SNAPC4Q5SXM2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
SNAPC4Q5SXM2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
SNAPC4Q5SXM2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
SNAPC4Q5SXM2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.52
SNAPC4Q5SXM2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.52
SNAPC4Q5SXM2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
SNAPC4Q5SXM2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
SNAPC4Q5SXM2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
SNAPC4Q5SXM2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
SNAPC4Q5SXM2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
SNAPC4Q5SXM2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
SNAPC4Q5SXM2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
SNAPC4Q5SXM2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
SNAPC4Q5SXM2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
SNAPC4Q5SXM2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
SNAPC4Q5SXM2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
SNAPC4Q5SXM2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
SNAPC4Q5SXM2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
SNAPC4Q5SXM2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
SNAPC4Q5SXM2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
SNAPC4Q5SXM2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
SNAPC4Q5SXM2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
SNAPC4Q5SXM2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
SNAPC4Q5SXM2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC43.24■■■■■ 4.51
SNAPC4Q5SXM2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
SNAPC4Q5SXM2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
SNAPC4Q5SXM2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms