Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFHC1Q5JVL4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFHC1Q5JVL4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFHC1Q5JVL4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFHC1Q5JVL4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFHC1Q5JVL4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFHC1Q5JVL4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFHC1Q5JVL4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFHC1Q5JVL4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFHC1Q5JVL4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFHC1Q5JVL4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFHC1Q5JVL4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EFHC1Q5JVL4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EFHC1Q5JVL4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EFHC1Q5JVL4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EFHC1Q5JVL4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
EFHC1Q5JVL4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EFHC1Q5JVL4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
EFHC1Q5JVL4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EFHC1Q5JVL4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EFHC1Q5JVL4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
EFHC1Q5JVL4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EFHC1Q5JVL4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFHC1Q5JVL4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFHC1Q5JVL4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EFHC1Q5JVL4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EFHC1Q5JVL4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EFHC1Q5JVL4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EFHC1Q5JVL4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EFHC1Q5JVL4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EFHC1Q5JVL4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EFHC1Q5JVL4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EFHC1Q5JVL4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
EFHC1Q5JVL4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EFHC1Q5JVL4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EFHC1Q5JVL4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EFHC1Q5JVL4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EFHC1Q5JVL4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EFHC1Q5JVL4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EFHC1Q5JVL4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EFHC1Q5JVL4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EFHC1Q5JVL4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EFHC1Q5JVL4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EFHC1Q5JVL4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EFHC1Q5JVL4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EFHC1Q5JVL4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EFHC1Q5JVL4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms