Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NOM1Q5C9Z4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NOM1Q5C9Z4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NOM1Q5C9Z4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NOM1Q5C9Z4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
NOM1Q5C9Z4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NOM1Q5C9Z4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NOM1Q5C9Z4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NOM1Q5C9Z4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NOM1Q5C9Z4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NOM1Q5C9Z4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NOM1Q5C9Z4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NOM1Q5C9Z4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NOM1Q5C9Z4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NOM1Q5C9Z4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NOM1Q5C9Z4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NOM1Q5C9Z4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NOM1Q5C9Z4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NOM1Q5C9Z4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
NOM1Q5C9Z4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NOM1Q5C9Z4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NOM1Q5C9Z4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NOM1Q5C9Z4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NOM1Q5C9Z4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NOM1Q5C9Z4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NOM1Q5C9Z4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NOM1Q5C9Z4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NOM1Q5C9Z4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NOM1Q5C9Z4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NOM1Q5C9Z4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NOM1Q5C9Z4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NOM1Q5C9Z4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NOM1Q5C9Z4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NOM1Q5C9Z4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NOM1Q5C9Z4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NOM1Q5C9Z4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NOM1Q5C9Z4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NOM1Q5C9Z4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NOM1Q5C9Z4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NOM1Q5C9Z4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
NOM1Q5C9Z4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NOM1Q5C9Z4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NOM1Q5C9Z4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NOM1Q5C9Z4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NOM1Q5C9Z4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
NOM1Q5C9Z4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NOM1Q5C9Z4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NOM1Q5C9Z4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NOM1Q5C9Z4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NOM1Q5C9Z4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NOM1Q5C9Z4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NOM1Q5C9Z4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NOM1Q5C9Z4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NOM1Q5C9Z4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NOM1Q5C9Z4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NOM1Q5C9Z4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NOM1Q5C9Z4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NOM1Q5C9Z4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NOM1Q5C9Z4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NOM1Q5C9Z4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NOM1Q5C9Z4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NOM1Q5C9Z4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NOM1Q5C9Z4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NOM1Q5C9Z4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NOM1Q5C9Z4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NOM1Q5C9Z4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NOM1Q5C9Z4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NOM1Q5C9Z4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NOM1Q5C9Z4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NOM1Q5C9Z4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NOM1Q5C9Z4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NOM1Q5C9Z4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NOM1Q5C9Z4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NOM1Q5C9Z4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NOM1Q5C9Z4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NOM1Q5C9Z4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms