Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKN3Q16667 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKN3Q16667 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKN3Q16667 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKN3Q16667 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKN3Q16667 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDKN3Q16667 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDKN3Q16667 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDKN3Q16667 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDKN3Q16667 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKN3Q16667 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKN3Q16667 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKN3Q16667 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKN3Q16667 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKN3Q16667 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKN3Q16667 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKN3Q16667 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDKN3Q16667 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKN3Q16667 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKN3Q16667 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKN3Q16667 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKN3Q16667 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKN3Q16667 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKN3Q16667 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKN3Q16667 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKN3Q16667 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKN3Q16667 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKN3Q16667 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKN3Q16667 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKN3Q16667 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKN3Q16667 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKN3Q16667 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKN3Q16667 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKN3Q16667 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN3Q16667 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN3Q16667 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN3Q16667 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN3Q16667 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKN3Q16667 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKN3Q16667 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKN3Q16667 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDKN3Q16667 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CDKN3Q16667 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDKN3Q16667 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKN3Q16667 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKN3Q16667 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDKN3Q16667 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKN3Q16667 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKN3Q16667 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKN3Q16667 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN3Q16667 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN3Q16667 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN3Q16667 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKN3Q16667 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDKN3Q16667 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKN3Q16667 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKN3Q16667 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKN3Q16667 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKN3Q16667 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKN3Q16667 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKN3Q16667 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKN3Q16667 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKN3Q16667 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKN3Q16667 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKN3Q16667 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKN3Q16667 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKN3Q16667 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKN3Q16667 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKN3Q16667 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKN3Q16667 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKN3Q16667 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKN3Q16667 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDKN3Q16667 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDKN3Q16667 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDKN3Q16667 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDKN3Q16667 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
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