Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDK3Q15120 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDK3Q15120 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDK3Q15120 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDK3Q15120 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDK3Q15120 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDK3Q15120 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDK3Q15120 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDK3Q15120 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDK3Q15120 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDK3Q15120 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDK3Q15120 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDK3Q15120 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDK3Q15120 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDK3Q15120 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDK3Q15120 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK3Q15120 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK3Q15120 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK3Q15120 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK3Q15120 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDK3Q15120 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDK3Q15120 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDK3Q15120 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDK3Q15120 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDK3Q15120 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDK3Q15120 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDK3Q15120 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDK3Q15120 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDK3Q15120 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDK3Q15120 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDK3Q15120 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDK3Q15120 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDK3Q15120 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDK3Q15120 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDK3Q15120 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDK3Q15120 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDK3Q15120 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDK3Q15120 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDK3Q15120 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDK3Q15120 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDK3Q15120 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDK3Q15120 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDK3Q15120 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms