Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NWD1Q149M9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NWD1Q149M9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NWD1Q149M9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NWD1Q149M9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NWD1Q149M9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NWD1Q149M9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NWD1Q149M9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NWD1Q149M9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NWD1Q149M9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NWD1Q149M9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NWD1Q149M9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NWD1Q149M9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NWD1Q149M9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NWD1Q149M9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NWD1Q149M9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NWD1Q149M9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NWD1Q149M9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NWD1Q149M9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NWD1Q149M9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NWD1Q149M9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
NWD1Q149M9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NWD1Q149M9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NWD1Q149M9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NWD1Q149M9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NWD1Q149M9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
NWD1Q149M9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NWD1Q149M9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
NWD1Q149M9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NWD1Q149M9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NWD1Q149M9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NWD1Q149M9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NWD1Q149M9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NWD1Q149M9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
NWD1Q149M9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
NWD1Q149M9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
NWD1Q149M9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NWD1Q149M9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
NWD1Q149M9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NWD1Q149M9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NWD1Q149M9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NWD1Q149M9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NWD1Q149M9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NWD1Q149M9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NWD1Q149M9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NWD1Q149M9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
NWD1Q149M9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
NWD1Q149M9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
NWD1Q149M9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NWD1Q149M9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NWD1Q149M9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NWD1Q149M9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NWD1Q149M9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NWD1Q149M9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NWD1Q149M9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NWD1Q149M9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NWD1Q149M9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
NWD1Q149M9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NWD1Q149M9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NWD1Q149M9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NWD1Q149M9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NWD1Q149M9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NWD1Q149M9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NWD1Q149M9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NWD1Q149M9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NWD1Q149M9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NWD1Q149M9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NWD1Q149M9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NWD1Q149M9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NWD1Q149M9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NWD1Q149M9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NWD1Q149M9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NWD1Q149M9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NWD1Q149M9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NWD1Q149M9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NWD1Q149M9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NWD1Q149M9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NWD1Q149M9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NWD1Q149M9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NWD1Q149M9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NWD1Q149M9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NWD1Q149M9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
NWD1Q149M9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NWD1Q149M9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NWD1Q149M9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NWD1Q149M9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NWD1Q149M9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NWD1Q149M9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NWD1Q149M9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NWD1Q149M9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NWD1Q149M9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
NWD1Q149M9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NWD1Q149M9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
NWD1Q149M9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
NWD1Q149M9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
NWD1Q149M9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
NWD1Q149M9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NWD1Q149M9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NWD1Q149M9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NWD1Q149M9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
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